Ideal Candidate
Descrierea job-ului: CERCETATOR STIINTIFIC
Program lucru: norma part-time 4h
Perioada determinata: proiect cercetare pana in iulie 2027 inclusiv
Locatie: Iasi, hybrid
Cautam persoane cu urmatoarele skill-uri si experienta:
- Deținerea titlului de doctor sau doctorand într-un domeniu relevant pentru tematica proiectului: biologie/chimie/biochimie/biotehnologii/medicină/farmacie/IT sau domenii conexe
- Cunostinte de programare junior level (Python, R, Bash), lucrul cu sisteme de operare Linux, Windows
- Limbi străine cunoscute: engleză avansat (citire literatură, comunicare tehnică)
- Atenție la detalii, gândire analitică, capacitate de lucru autonom și în echipă, respectarea termenelor conform diagramei Gantt
- Experiență practică în analiza datelor NGS (ideal: genomică umană; avantaj: analiză a secvențelor de tip long-read prin ONT).
- Autor sau co-autor a minimum două articole științifice publicate în reviste de specialitate internaționale, indexate în Web of Science.
Cerinte ce constituie avantaj:
- Experiență cu Oxford Nanopore (MinKNOW/EPI2ME/Nextflow) sau cu fluxuri similare.
• Experiență în CNV calling / PGT-A (low-pass, mozaicism) sau validare inter-platformă (Illumina vs ONT).
• Experiență în analiză de microbiom (16S sau metagenomică).
• Experiență cu formate clinice și/sau platforme de interpretare (ex. Euformatics, Omnomics, IGV).
Program lucru: norma part-time 4h
Perioada determinata: proiect cercetare pana in iulie 2027 inclusiv
Locatie: Iasi, hybrid
Cautam persoane cu urmatoarele skill-uri si experienta:
- Deținerea titlului de doctor sau doctorand într-un domeniu relevant pentru tematica proiectului: biologie/chimie/biochimie/biotehnologii/medicină/farmacie/IT sau domenii conexe
- Cunostinte de programare junior level (Python, R, Bash), lucrul cu sisteme de operare Linux, Windows
- Limbi străine cunoscute: engleză avansat (citire literatură, comunicare tehnică)
- Atenție la detalii, gândire analitică, capacitate de lucru autonom și în echipă, respectarea termenelor conform diagramei Gantt
- Experiență practică în analiza datelor NGS (ideal: genomică umană; avantaj: analiză a secvențelor de tip long-read prin ONT).
- Autor sau co-autor a minimum două articole științifice publicate în reviste de specialitate internaționale, indexate în Web of Science.
Cerinte ce constituie avantaj:
- Experiență cu Oxford Nanopore (MinKNOW/EPI2ME/Nextflow) sau cu fluxuri similare.
• Experiență în CNV calling / PGT-A (low-pass, mozaicism) sau validare inter-platformă (Illumina vs ONT).
• Experiență în analiză de microbiom (16S sau metagenomică).
• Experiență cu formate clinice și/sau platforme de interpretare (ex. Euformatics, Omnomics, IGV).
Job Description
Responsabilități principale:
Analiză date NGS/ONT (genomică umană):
• Curățare, organizare și verificare calitate date generate prin secvențiere de tip long-reads prin platforma Oxford Nanopore Technologies.
• Utilizare programe dedicate și script-uri in-house pentru aliniere la genomuri de referință și QC
• Identificare variante genetice (SNP/indel; CNV/SV după caz) și pregătire livrabile (rapoarte, VCF/BAM) pentru echipa clinică/interpretare.
• Optimizarea analizei CNV (inclusiv în cazuri de mozaicism embrionar) și compararea cu rezultate obținute prin platforma de secvențiere Illumina pe aceleași probe (concordanță și documentarea discrepanțelor).
• Analiză microbiom (16S / metataxonomie):
• Rulare și interpretare fluxuri de analiză pentru probe endometriale cu componentă bacteriană (ex. clasificare taxonomică, abundențe relative, indici de diversitate), generare rapoarte/tabele pentru echipa clinică.
Documentare & standardizare (SOP):
• Actualizare ghiduri de lucru (SOP) pentru fluxuri (human-variation / CNV / SNP / 16S), cu pași clari pentru colegi non-bioinformaticieni.
• Troubleshooting și comunicare cu furnizori de software/platforme, atunci când e necesar.
• Colaborare activă cu echipa wet-lab, clinicieni, alți cercetători din echipă prin participarea la ședințe și workshop-uri
• Sprijin la redactarea materialelor științifice (articole științifice, conferințe, rapoarte) și diseminare bune practici.
• Contribuie activ la atingerea indicatorilor și obiectivelor proiectului.
Analiză date NGS/ONT (genomică umană):
• Curățare, organizare și verificare calitate date generate prin secvențiere de tip long-reads prin platforma Oxford Nanopore Technologies.
• Utilizare programe dedicate și script-uri in-house pentru aliniere la genomuri de referință și QC
• Identificare variante genetice (SNP/indel; CNV/SV după caz) și pregătire livrabile (rapoarte, VCF/BAM) pentru echipa clinică/interpretare.
• Optimizarea analizei CNV (inclusiv în cazuri de mozaicism embrionar) și compararea cu rezultate obținute prin platforma de secvențiere Illumina pe aceleași probe (concordanță și documentarea discrepanțelor).
• Analiză microbiom (16S / metataxonomie):
• Rulare și interpretare fluxuri de analiză pentru probe endometriale cu componentă bacteriană (ex. clasificare taxonomică, abundențe relative, indici de diversitate), generare rapoarte/tabele pentru echipa clinică.
Documentare & standardizare (SOP):
• Actualizare ghiduri de lucru (SOP) pentru fluxuri (human-variation / CNV / SNP / 16S), cu pași clari pentru colegi non-bioinformaticieni.
• Troubleshooting și comunicare cu furnizori de software/platforme, atunci când e necesar.
• Colaborare activă cu echipa wet-lab, clinicieni, alți cercetători din echipă prin participarea la ședințe și workshop-uri
• Sprijin la redactarea materialelor științifice (articole științifice, conferințe, rapoarte) și diseminare bune practici.
• Contribuie activ la atingerea indicatorilor și obiectivelor proiectului.
Company Description
Fertigyn SRL prin Origyn Fertility Center își mărește echipa în cadrul proiectului de cercetare-inovare “Revoluționarea reproducerii umane asistate medical prin cercetare, inovare si investiții”, cod SMIS 338525, finanțat prin Programul Regional Nord-Est 2021-2027
Similar jobs
- Apr 21, 2026
